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FischDB – die Fischdatenbank
Eine Internetdatenbank zur Verbesserung der Kontrolle von Fischerei-Erzeugnissen durch Protein- und DNA-Analyse.
Die Kontrolle der Kennzeichnung von Erzeugnissen aus Fischen, Krebs- und Weichtieren obliegt in Deutschland den Institutionen der amtlichen Lebensmittelüberwachung. Kaum eine andere Gruppe von Lebensmitteln zeichnet sich durch eine so große Angebotsvielfalt aus wie die Fischerei-Erzeugnisse. Allein in Deutschland sind Produkte von über 500 aquatischen Tierarten auf dem Markt, die sich nicht nur in sensorischer, sondern auch in preislicher Hinsicht stark unterscheiden. Unter dem Aspekt der Lebensmittelsicherheit sind Fischerei-Erzeugnisse häufig kritischer zu betrachten als andere Produkte.
Im Rahmen des Projektes "Erstellung eines Fischkatalogs mit allen analytisch verfügbaren Da-ten zur molekularbiologischen Fischdifferenzierung" wurde im Auftrag des Bundesamtes für Lebensmittel und Ernährung (BLE) eine Datenbank zur Überprüfung der Etikettierung von Fischprodukten erstellt. Die inhaltliche Umsetzung erfolgte durch die Hochschule Bremen (Internationaler Studiengang für Technische und Angewandte Biologie, Prof. Dr. Heiko Brun-ken) in Zusammenarbeit mit der Bundesforschungsanstalt für Ernährung und Lebensmittel (BFEL).
planomedia erstellte die datenbankbasierte Software FischDB zur Verwaltung biologischer Fischdaten. Die Aufarbeitung von DNA-Sequenzen mariner Organismen wurde von der Impetus GmbH & Co. Bioscience KG durchgeführt.
Entstanden ist dabei eine innovative, CMS-gestüzte Plattform, die sich in drei Bereiche gliedert:
- Recherche
- Pflege der Datenbankinhalte
- Administration
Für die Recherche ist die Datenbank im Internet unter folgender Adresse frei zugänglich:
Bei der Entwicklung der Software wurde insbesondere auf Anpassbarkeit, Sicherheit, Datentransparenz sowie ein einfaches, intuitiv zu bedienendes Benutzerinterface Wert gelegt.
Dem Benutzer präsentiert sich die Startseite mit einer Suchmaske, in der entweder ein Suchbegriff für eine Volltextsuche oder Bestandteile eines lateinischen Namens einer Fischart eingegeben werden können. Die Suchergebnisse werden in einer Liste dargestellt und mit den entsprechenden Datensätzen verlinkt. Die Datenbank enthält analytische Daten von zurzeit handelsüblichen Fischen, Mollusken und Crustaceen zu:
- IEF - Isoelektrische Fokussierung
- SSCP - Single Strand Conformational Polymorphism
- RFLP - Restriction Fragment Length Polymorphism
- DNA - DNA-Sequenz eines für die Artbestimmung definierten Bereichs
- Alignment - Vergleich mehrerer DNA-Sequenzen
Diese Datensätze werden durch Reiter repräsentiert. Durch Auswahl eines Reiters gelangt man zu der gewünschten Ansicht. Außerdem verfügt das System über eine alphabetische Auflistung aller Fischarten, Gene, Primer, der SSCP-Datenblätter sowie allgemeine Informationen zu den eingesetzten Analyseverfahren.
Die Anpassung der Datenbankinhalte erfolgt über einen passwortgeschützten Zugang. Berechtigte Anwender können Fischdaten in einem dialogbasierten System über spezielle Eingabemasken eintragen oder ändern. Dabei werden Daten, die in mehreren Fischarten vorkommen, nur einmal eingetragen und in den betroffenen Datenblättern referenziert. Damit wird der erforderliche Arbeitsaufwand auf ein Minimum reduziert, und die durchgehende Aktualisierung im Fall einer nachträglichen Änderung wird gewährleistet.
Die Datenbank verfügt über eine fein granulierbare Rechteverwaltung und ein integriertes Workflow-Management. Bei Änderung oder Neuanlage werden die Inhalte zuerst einem Redakteur zur Revision vorgelegt. Erst nachdem der Redakteur der Veröffentlichung zustimmt, wird eine Änderung im öffentlich zugänglichen Bereich sichtbar. Die Benutzer- und Rechteverwaltung kann im Administrationsbereich konfiguriert werden.
FischDB wurde auf der Basis des Application Servers Zope und des Content Management Systems Plone umgesetzt, was eine schnelle und kostengünstige Realisierung des Projekts ermöglichte. Entwicklung von kundenspezifischer Software in einer Zope-Umgebung gehört zum Kernkompetenzbereich von planomedia. Ergänzend zur Entwicklung CMS-basierter Software bietet planomedia Hosting und barrierefreies Webdesign an.
Die Fischdatenbank wird auf den Servern von planomedia gehostet, die inhaltliche Pflege erfolgt durch die Bundesforschungsanstalt für Ernährung und Lebensmittel (BFEL).